21世紀(jì)初，日本生物科技高度發(fā)達(dá)，其所研制并獨(dú)家壟斷的生物機(jī)器人極大推進(jìn)了時(shí)代的進(jìn)步，但同時(shí)其潛在的危害性也不斷受到世界各國(guó)的指摘。不滿于其他國(guó)家對(duì)該技術(shù)限制的呼聲，日本于2067年單方面退出聯(lián)合國(guó)，用高科技手段屏蔽一切外來(lái)信號(hào)，再次進(jìn)入鎖國(guó)狀態(tài)。
　　此后整整10年間，關(guān)于日本的現(xiàn)狀外界一無(wú)所知。美國(guó)政府急于了解日本當(dāng)前的狀況，雖派出特種部隊(duì)SWORD秘密潛入這個(gè)已經(jīng)封閉了十個(gè)年頭的神秘國(guó)家。當(dāng)特種隊(duì)員VEXILLE（黒木メイサ 音）和里昂（谷原章介 飾）進(jìn)入日本后，眼前的一切卻令他們大吃一驚…