本片改編自TYPE-MOON出品的文字冒險類游戲《Fate/stay night》，是該游戲的Heaven's Feel路線，簡稱“HF”或“櫻線”，是該系列作品動畫劇場版全三部作品中的最終章。
　　在劇場版作品第二章黑化之后的櫻吸收了眾多Servant的靈魂后，被世間 所有的惡控制，成為黑色圣杯的化身。
　　最終，得知一切的士郎放棄了成為正義的伙伴，選擇了保護櫻...